El Archivo General del Instituto Electoral del Estado de México desempeña un rol fundamental en la preservación de la historia y la transparencia institucional.

El IEEM organiza, conserva y resguarda documentos históricos, como el Acta de Instalación del Consejo General en 1996, actas y acuerdos del Consejo General y la Junta General, y documentación de elecciones locales ordinarias y extraordinarias.
El IEEM dispone de un Archivo de Trámite para documentos administrativos vigentes por dos años, luego transferidos al Archivo de Concentración por cinco años. El acervo incluye 17 mil 074 volúmenes, 216 mil 674 expedientes y 15 millones 700 mil 182 fojas.
En 2020, se introdujo el Sistema de Gestión Documental, que digitaliza seguimientos y atenciones de asuntos para su ubicación inmediata. Con 499 mil 196 documentos y 7 mil 921 expedientes electrónicos registrados entre 2020 y 2022, este sistema moderniza la gestión documental.
Uno de los desafíos es inculcar una cultura archivística en la organización, conservación y uso adecuado de expedientes físicos y electrónicos. El personal del Archivo asesora en la operación y gestión del Sistema Institucional de Archivos, y el acervo está disponible al público a través de solicitudes de información pública.